当前，许多学校都在进行分层教学。一些学校理念上新一些，采取分层教学、走班上课，学生可根据自己每一科的成绩上不同难度的班，还有一些学校将班级分成重点班、普通班，更有一些学校每学期都进行考试大排名，学生随成绩而调整班级。
虽然在执行中各有高下，不过分层教学因为强调“因材施教”还是有其先进之处，但孙云晓认为，分层教学过度强化了教学，教育不只是一个认知的过程，而是一个综合培养的过程，除了学业成绩，还讲究合作、互助、责任，讲究综合素质的培养，现在单纯以认知来进行分层教学，是有问题的。
可以说，目前分层教学中只认成绩不认其他，使学生的学校生活过度依赖于学业成绩，并强化了竞争，“所谓基础教育，打的不仅是知识基础，还有做人的基础，要让孩子有正确的世界观、人生观、价值观，让他们明白什么是最有价值的，什么样的人生是有意义的，什么是生活的本质、成长的方向、人生的追求。”孙云晓说。显然，那些只重视学业成绩的教育改革，也到了要反省的时候。