作为扶贫工作的一种新途径，光伏扶贫在全国各地尚处在初期发展的阶段，其中存在的问题也无法回避。特别是，最近两年里频发的光伏扶贫电站的质量问题，如低价中标、选择低价劣质产品所带来的行业隐患等问题，严重影响了光伏扶贫产业的健康发展，已引起行业及相关管理部门的深度关注。
2016年初，国内某权威第三方机构对某省8个区县的光伏扶贫工程展开了一次专业的质量检查，结果显示：39个样本电站中，效率处于较好水平的仅为六成左右。不同电站的性能水平存在较大差异，少量电站的PR值低于60%，经测算收益水平远低于合理的收益率。部分电站施工质量较差、设备质量较差，以及在安全性能、施工质量、运行和维护等方面均存在不同程度的问题。
诸如在设计和施工方面存在：组件最佳安装角度、支架选择比较杂、基础设计随意性较强、项目施工偏差较大、项目配重不足、项目施工精度较差等方面的问题。
河北扶贫项目的一份调研报告也显示，部分电站在设备质量、施工质量方面存在着诸多隐患，比如逆变器由于风扇故障，造成停机;部分区域农网电能质量较差，逆变器设备频繁跳闸脱网，无人处理，农民的收益得不到稳定的保障。
对此，行业专家的建议可归纳为四点：第一，电站建设一定要做好前期准备工作，特别是电站站址的选择和统筹。第二，要进一步严格承建单位和光伏扶贫的准入条件，强化技术评审和管理。第三，建立行业标准，严格要求扶贫电站设备造型，选择行业内一线品牌，从源头保证电站25年的安全可靠运行。第四，针对多数扶贫电站容量小、对工程和设备质量确保敏感度高的特点，可按区域建立统一的集控系统和运维管理制度，进一步规范运维、提高运维质量。